MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 40374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021738	GGC	2	6	298326	298331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655967
5002	NC_021738	GTA	2	6	298341	298346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655967
5003	NC_021738	GAA	2	6	298519	298524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655967
5004	NC_021738	AAT	2	6	298566	298571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655967
5005	NC_021738	GTA	2	6	298638	298643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655967
5006	NC_021738	T	6	6	298686	298691	0 %	100 %	0 %	0 %	525655967
5007	NC_021738	TTG	2	6	298737	298742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655967
5008	NC_021738	GGC	2	6	298757	298762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655967
5009	NC_021738	CTT	2	6	299009	299014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655968
5010	NC_021738	CTTT	2	8	299041	299048	0 %	75 %	0 %	25 %	525655968
5011	NC_021738	CAC	2	6	299057	299062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655968
5012	NC_021738	TTC	2	6	299094	299099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655968
5013	NC_021738	TGG	2	6	299152	299157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655968
5014	NC_021738	TTTC	2	8	299162	299169	0 %	75 %	0 %	25 %	525655968
5015	NC_021738	CGG	2	6	299222	299227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655968
5016	NC_021738	CTT	2	6	299342	299347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655968
5017	NC_021738	CGG	2	6	299390	299395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655968
5018	NC_021738	CCA	2	6	299431	299436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655968
5019	NC_021738	TGG	2	6	299528	299533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655968
5020	NC_021738	CAA	2	6	299627	299632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655968
5021	NC_021738	TTC	2	6	299754	299759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655968
5022	NC_021738	GCC	2	6	299782	299787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655968
5023	NC_021738	ATT	2	6	299886	299891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655968
5024	NC_021738	TTC	2	6	299940	299945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655968
5025	NC_021738	TAA	2	6	300047	300052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655968
5026	NC_021738	TCA	2	6	300073	300078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655968
5027	NC_021738	T	6	6	300186	300191	0 %	100 %	0 %	0 %	525655968
5028	NC_021738	GCC	2	6	300252	300257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655968
5029	NC_021738	GCA	2	6	300307	300312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655968
5030	NC_021738	CAG	2	6	300365	300370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655968
5031	NC_021738	GAA	2	6	300404	300409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655968
5032	NC_021738	CAT	2	6	300410	300415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655968
5033	NC_021738	CTT	2	6	300428	300433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655968
5034	NC_021738	CTT	2	6	300682	300687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655969
5035	NC_021738	CCATAC	2	12	300817	300828	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	525655969
5036	NC_021738	CACC	2	8	300850	300857	25 %	0 %	0 %	75 %	525655969
5037	NC_021738	TGC	2	6	300890	300895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655969
5038	NC_021738	TCA	2	6	300901	300906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655969
5039	NC_021738	CTT	2	6	300979	300984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655969
5040	NC_021738	CA	3	6	300994	300999	50 %	0 %	0 %	50 %	525655969
5041	NC_021738	CAT	2	6	301103	301108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655969
5042	NC_021738	CTG	2	6	301126	301131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655969
5043	NC_021738	CAA	2	6	301178	301183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655969
5044	NC_021738	CAC	2	6	301186	301191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655969
5045	NC_021738	AATTG	2	10	301245	301254	40 %	40 %	20 %	0 %	525655969
5046	NC_021738	AGAT	2	8	301263	301270	50 %	25 %	25 %	0 %	525655969
5047	NC_021738	CTT	2	6	301312	301317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655969
5048	NC_021738	GAAC	2	8	301318	301325	50 %	0 %	25 %	25 %	525655969
5049	NC_021738	CAC	2	6	301336	301341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655969
5050	NC_021738	TAC	2	6	301424	301429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655969
5051	NC_021738	TGG	2	6	301438	301443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655969
5052	NC_021738	AGA	2	6	301472	301477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655969
5053	NC_021738	TAA	2	6	301639	301644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655969
5054	NC_021738	CTG	2	6	301682	301687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655969
5055	NC_021738	T	6	6	301711	301716	0 %	100 %	0 %	0 %	525655969
5056	NC_021738	AGA	2	6	301774	301779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655969
5057	NC_021738	T	6	6	301799	301804	0 %	100 %	0 %	0 %	525655969
5058	NC_021738	GTA	2	6	301851	301856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655969
5059	NC_021738	CAC	2	6	301931	301936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655969
5060	NC_021738	T	6	6	301937	301942	0 %	100 %	0 %	0 %	525655969
5061	NC_021738	CAT	2	6	301957	301962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655969
5062	NC_021738	GCA	2	6	301971	301976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655969
5063	NC_021738	AAT	2	6	302012	302017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655969
5064	NC_021738	GCT	2	6	302112	302117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655969
5065	NC_021738	ACCA	2	8	302159	302166	50 %	0 %	0 %	50 %	525655969
5066	NC_021738	TCT	2	6	302178	302183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655969
5067	NC_021738	ATA	2	6	302277	302282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655969
5068	NC_021738	AGC	2	6	302302	302307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655969
5069	NC_021738	CAC	2	6	302333	302338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655969
5070	NC_021738	CTT	2	6	302362	302367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655969
5071	NC_021738	CAT	2	6	302393	302398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655969
5072	NC_021738	AAAT	2	8	302428	302435	75 %	25 %	0 %	0 %	525655969
5073	NC_021738	CTT	2	6	302599	302604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655969
5074	NC_021738	GAA	2	6	302720	302725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655969
5075	NC_021738	TAC	2	6	302804	302809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655969
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5077	NC_021738	T	6	6	302919	302924	0 %	100 %	0 %	0 %	525655969
5078	NC_021738	AGCA	2	8	302996	303003	50 %	0 %	25 %	25 %	525655969
5079	NC_021738	TGC	2	6	303035	303040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655969
5080	NC_021738	TGG	2	6	303103	303108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655969
5081	NC_021738	ATA	2	6	303235	303240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655969
5082	NC_021738	GCC	2	6	303243	303248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655969
5083	NC_021738	TAC	2	6	303362	303367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655969
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5085	NC_021738	CAT	2	6	303436	303441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655969
5086	NC_021738	ATC	2	6	303470	303475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655969
5087	NC_021738	TGA	2	6	303596	303601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655969
5088	NC_021738	TTGC	2	8	303760	303767	0 %	50 %	25 %	25 %	525655969
5089	NC_021738	TAA	2	6	303820	303825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655969
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5091	NC_021738	TCA	2	6	304111	304116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655970
5092	NC_021738	GCA	2	6	304127	304132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655970
5093	NC_021738	CATA	2	8	304148	304155	50 %	25 %	0 %	25 %	525655970
5094	NC_021738	ACG	2	6	304180	304185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655970
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5096	NC_021738	ATTA	2	8	304278	304285	50 %	50 %	0 %	0 %	525655970
5097	NC_021738	ACATTC	2	12	304489	304500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655970
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5099	NC_021738	GTAG	2	8	304590	304597	25 %	25 %	50 %	0 %	525655970
5100	NC_021738	CTG	2	6	304723	304728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655970
5101	NC_021738	CTA	2	6	304736	304741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655970
5102	NC_021738	T	6	6	304752	304757	0 %	100 %	0 %	0 %	525655970
5103	NC_021738	ACCG	2	8	304845	304852	25 %	0 %	25 %	50 %	525655970
5104	NC_021738	TGGT	2	8	304859	304866	0 %	50 %	50 %	0 %	525655970
5105	NC_021738	GTC	2	6	304879	304884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655970
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5107	NC_021738	T	6	6	304941	304946	0 %	100 %	0 %	0 %	525655970
5108	NC_021738	T	6	6	304958	304963	0 %	100 %	0 %	0 %	525655970
5109	NC_021738	GCA	2	6	304978	304983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655970
5110	NC_021738	CAAT	2	8	304988	304995	50 %	25 %	0 %	25 %	525655970
5111	NC_021738	AAT	2	6	305124	305129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655971
5112	NC_021738	CCA	2	6	305189	305194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655971
5113	NC_021738	AAT	2	6	305241	305246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655971
5114	NC_021738	AATT	2	8	305268	305275	50 %	50 %	0 %	0 %	525655971
5115	NC_021738	TCA	2	6	305293	305298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655971
5116	NC_021738	TCA	2	6	305320	305325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655971
5117	NC_021738	T	6	6	305385	305390	0 %	100 %	0 %	0 %	525655971
5118	NC_021738	ATC	2	6	305499	305504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655971
5119	NC_021738	TAAAG	2	10	305513	305522	60 %	20 %	20 %	0 %	525655971
5120	NC_021738	CTT	2	6	305549	305554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655971
5121	NC_021738	TAC	2	6	305561	305566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655971
5122	NC_021738	CTT	2	6	305588	305593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655971
5123	NC_021738	TCT	2	6	305638	305643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655971
5124	NC_021738	AGC	2	6	305942	305947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655972
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5127	NC_021738	GAT	2	6	306127	306132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655973
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5134	NC_021738	GAA	2	6	306533	306538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655973
5135	NC_021738	CTG	2	6	306563	306568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655973
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5223	NC_021738	CAT	2	6	318616	318621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655978
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5238	NC_021738	TCA	3	9	319608	319616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655978
5239	NC_021738	AAGCC	2	10	319653	319662	40 %	0 %	20 %	40 %	525655978
5240	NC_021738	CTTG	2	8	319705	319712	0 %	50 %	25 %	25 %	525655978
5241	NC_021738	CAT	2	6	319739	319744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655978
5242	NC_021738	A	7	7	319748	319754	100 %	0 %	0 %	0 %	525655978
5243	NC_021738	ATG	2	6	319757	319762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655978
5244	NC_021738	ACC	2	6	319802	319807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655978
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5246	NC_021738	AG	3	6	319935	319940	50 %	0 %	50 %	0 %	525655978
5247	NC_021738	GTT	2	6	320007	320012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655978
5248	NC_021738	ATT	2	6	320254	320259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655979
5249	NC_021738	TGA	2	6	320303	320308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655979
5250	NC_021738	TGA	2	6	320316	320321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655979
5251	NC_021738	CCGTT	2	10	320376	320385	0 %	40 %	20 %	40 %	525655979
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5255	NC_021738	TCT	2	6	321681	321686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655980
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5258	NC_021738	ATA	2	6	322203	322208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655981
5259	NC_021738	A	6	6	322220	322225	100 %	0 %	0 %	0 %	525655981
5260	NC_021738	TGA	2	6	322261	322266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655981
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5264	NC_021738	TGA	2	6	322512	322517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655981
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5271	NC_021738	GCA	2	6	322819	322824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655981
5272	NC_021738	ATT	2	6	322829	322834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655981
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5274	NC_021738	CAA	2	6	323083	323088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655982
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5281	NC_021738	GCT	2	6	323581	323586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655982
5282	NC_021738	GCT	2	6	323635	323640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655982
5283	NC_021738	CGC	2	6	323644	323649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655982
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5307	NC_021738	A	7	7	324716	324722	100 %	0 %	0 %	0 %	525655984
5308	NC_021738	A	6	6	324749	324754	100 %	0 %	0 %	0 %	525655984
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5316	NC_021738	CTTTA	2	10	325181	325190	20 %	60 %	0 %	20 %	525655984
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5319	NC_021738	ACG	2	6	325548	325553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655984
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5322	NC_021738	GAA	2	6	325781	325786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655984
5323	NC_021738	TGT	2	6	325808	325813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655984
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5342	NC_021738	GTG	2	6	326788	326793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655985
5343	NC_021738	CTTG	2	8	326873	326880	0 %	50 %	25 %	25 %	525655985
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5348	NC_021738	TA	3	6	327968	327973	50 %	50 %	0 %	0 %	525655986
5349	NC_021738	TTTG	2	8	327996	328003	0 %	75 %	25 %	0 %	525655986
5350	NC_021738	CTG	3	9	328067	328075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655986
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5356	NC_021738	T	6	6	328406	328411	0 %	100 %	0 %	0 %	525655986
5357	NC_021738	AGT	2	6	328419	328424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655986
5358	NC_021738	CTT	2	6	328448	328453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655986
5359	NC_021738	AAG	2	6	328511	328516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655986
5360	NC_021738	AAC	2	6	328605	328610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655986
5361	NC_021738	TTC	2	6	328612	328617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655986
5362	NC_021738	TCA	2	6	328648	328653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655986
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5365	NC_021738	TCA	2	6	328882	328887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655986
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5373	NC_021738	TGGC	2	8	329356	329363	0 %	25 %	50 %	25 %	525655987
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5488	NC_021738	A	7	7	336284	336290	100 %	0 %	0 %	0 %	525655993
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5491	NC_021738	TCT	2	6	336431	336436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655993
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